Ci sono molti aspetti di un sistema di comunicazione in fibra ottica che devono essere configurati correttamente affinché il sistema funzioni correttamente. Molte volte i clienti credono che ci sia un problema con l'apparecchiatura e che necessiti di riparazione quando in realtà si tratta di un errore dell'operatore. Il problema più comune con i collegamenti in fibra ottica è un ponticello in fibra danneggiato o sporco. È consigliabile utilizzare sempre cappucci o coperchi sulle fibre quando non sono collegate. La maggior parte delle persone trascura di farlo e una fibra nuda rimarrà esposta alla polvere per settimane o mesi. Quando la fibra sporca viene inserita in una porta del connettore ottico, il materiale estraneo può occludere o attenuare il passaggio della luce tra i due trefoli di fibra. Poiché i collegamenti delle fibre avvengono per contatto fisico tra le due estremità della fibra levigata, è anche possibile che la polvere o lo sporco possano effettivamente danneggiare in modo permanente le fibre stesse. Un altro problema comune è l'accoppiamento di due fibre con diversi tipi di terminazione. È comune utilizzare terminazioni APC (Angled Physical Contact) per migliorare le prestazioni di perdita di ritorno per le applicazioni RF; tuttavia la maggior parte delle applicazioni digitali utilizza fibre levigate piatte. Non c'è nulla che impedisca a un utente di accoppiare due tipi di fibre dissimili e sembrerà che sia collegato correttamente. Tuttavia, il sistema non funzionerà correttamente o potrebbe funzionare solo in modo intermittente, aumentando ulteriormente la convinzione che l'apparecchiatura debba essere riparata. Prima di richiedere una riparazione RMA, un utente deve sempre pulire e controllare le fibre e i connettori ottici. Una grande percentuale delle volte, questo eliminerà la maggior parte dei problemi.