Er zijn veel aspecten van een glasvezelcommunicatiesysteem die correct moeten worden geconfigureerd om het systeem goed te laten werken. Vaak denken klanten dat er een probleem is met de apparatuur en dat deze moet worden gerepareerd, terwijl het in werkelijkheid een bedieningsfout is. Het meest voorkomende probleem met glasvezelverbindingen is een beschadigde of vuile glasvezeljumper. Het is het beste om altijd doppen of hoezen op vezels te gebruiken als ze niet zijn aangesloten. De meeste mensen doen dit niet en een kale vezel zal weken of maanden aan stof worden blootgesteld. Wanneer de vuile vezel in een optische connectorpoort wordt gestoken, kan het vreemde materiaal de doorgang van licht tussen de twee vezelstrengen afsluiten of verzwakken. Aangezien vezelverbindingen tot stand komen door fysiek contact tussen de twee gepolijste vezeluiteinden, is het ook mogelijk dat stof of vuil de vezels zelf permanent kan beschadigen. Een ander veelvoorkomend probleem is het paren van twee vezels met verschillende soorten aansluitingen. Het is gebruikelijk om APC-afsluitingen (Angled Physical Contact) te gebruiken om de retourverliesprestaties voor RF-toepassingen te verbeteren; de meeste digitale toepassingen gebruiken echter vlak gepolijste vezels. Niets weerhoudt een gebruiker ervan om twee ongelijksoortige vezeltypes met elkaar te verbinden, en het lijkt alsof het correct is aangesloten. Het systeem zal echter niet correct functioneren, of slechts af en toe werken, wat nog meer bijdraagt aan de overtuiging dat de apparatuur gerepareerd moet worden. Voordat een RMA-reparatie wordt aangevraagd, moet een gebruiker altijd zijn vezels en optische connectoren reinigen en controleren. Een groot percentage van de tijd lost dit de meeste problemen op.